Muitos que iniciam em ASP. NET tem dúvidas sobre as pastas padrões do ASP,NET. Abaixo tem uma breve descrição de cada uma delas.

App_Code:
Pasta para armazenar as classes, enum. Bom lugar para colocar as classes Util.

App_Themes
Uma nova funcionalidade do ASP.NET 2.0 é que ele suporta temas. Nessa pasta deverá conter os arquivos stylesheet(.css), skins e imagens do tema.

App_Data
Responsável para armazenar arquivos de dados, como por exemplo, mdf e xml.

App_GlobalResources
Local onde deverá armazenar os arquivos de Resources (.resx). Muito util para criar aplicações em multi-línguas.

App_LocalResources
Armazenar Resources locais.

App_WebReferences
Armazenar referencia de WebServices.

App_Browsers
Armazenar arquivos XML usando para configurar características especiais para cada tipo de navegador.